FK „Žalgiris“ yra legendinis Lietuvos futbolo klubas, kovojęs TSRS II-oje, I-oje ir aukščiausioje futbolo lygose (1947–1989), Lietuvos A lygoje (1990–2008), UEFA organizuojamuose Europos turnyruose.

1987 metais aukščiausiame TSRS divizione vilniečiai iškovojo bronzos medalius.

Per 20 sezonų A lygoje „Žalgiris“ iškovojo tris Lietuvos čempionų titulus (1991, 1992 ir 1999 m.), penkis kartus laimėjo LFF taurę, kartą – LFF Supertaurę.

UEFA organizuojamuose turnyruose „Žalgiris“ dalyvavo 16 kartų, rungtyniavo su tokiomis komandomis kaip Eindhoveno PSV ir Roterdamo „Feyenoord“ (abi – Olandija), Kijevo „Dinamo“ (Ukraina) ir kt.

Dėl rimtų finansinių problemų FK „Žalgiris“ nuo 2008 metų sezono tapo neveiksniu.

2009 metais komandos žaidėjai, treneriai ir „Pietų IV“ sirgaliai, siekdami išsaugoti „Žalgirio“ vardą, atsiskyrė nuo FK „Žalgiris“ ir įkūrė Vilniaus miesto futbolo draugiją (VMFD) „Žalgiris“. Oficialiai (VMFD) „Žalgiris“ įkurta 2009 metų vasario 23 dieną.

2009-ųjų kovo mėnesį LFF išimties tvarka suteikė galimybę VMFD „Žalgiriui“ rungtis I lygoje. Išlaikomas ir palaikomas ištikimiausių žaidėjų ir „Pietų IV“ sirgalių, 2009 metų sezone VMFD „Žalgiris“ I lygoje iškovojo šeštąją vietą.

2009 metų pabaigoje Lietuvos kūno kultūros ir sporto departamento direktoriaus pavaduotojo paskirto eiti generalinio direktoriaus pareigas Rito Vaigino iniciatyva, buvo suburta „Žalgirio“ atkūrimo projekto grupė.

Grupė iniciatyvių, futbolo verslą išmanančių žmonių, parengė „Žalgirio“ atkūrimo viziją, surado rėmėjus, parengė „Žalgirį“ licencijavimui, subūrė geriausiems Lietuvos futbolo klubams konkurencingą komandą.

Pirmoji „Žalgirio“ atgimimo projektu patikėjo viena didžiausių Europoje internetinius lošimus organizuojančių bendrovių – UNIBET. Ši užsienio kompanija 2010 metų sausio 28 dieną oficialiai tapo „Žalgirio“ pagrindiniu rėmėju 2010 metų sezonui.

Supažindintas su bendruomeninio klubo idėja, pagalbos ranką ištiesė Vilniaus meras Vilius Navickas. Kartu su juo žengė ir Vilniaus miesto Taryba. 2010 metų vasario 24 dieną Vilniaus miesto savivaldybė tapo „Žalgirio“ dalininke.

2010 metų kovo 12 dieną, pritarus UEFA, LFF vadovai oficialiai atvėrė A lygos duris VMFD „Žalgiris“. Sugrįžęs į A lygą, VMFD „Žalgiris“ iškovojo prizinę 3 vietą bei buvo pripažinta korektiškiausia A lygos komanda.

2011 metų sezone komandai sekėsi daug geriau – ji sudarė rimtą konkurenciją Panevėžio „Ekrano“ komandai. Tačiau nesėkmės leido užimti antrąją vietą A lygoje. Rezultatyviausiu A lygos žaidėju tapo 19 kartų pasižymėjęs Deivydas Matulevičius.

Praėjus trejiems metams nuo VMFD „Žalgiris“ įkūrimo ir nuveikus daug sunkių darbų, buvo iškovotas pirmasis trofėjus – LFF taurė, kuri į Vilnių grįžo po 9-erių metų pertraukos. Gegužės 20-ą dieną Marijampolėje po nulinėmis lygiosiomis pasibaigusio pagrindinio laiko, 11 metrų baudinių serijoje 3:1 buvo įveiktas titulą gynęs Panevėžio „Ekranas“. Tiesa, šiam klubui šalies pirmenybėse buvo nusileista vos vienu tašku.

2013 metų sezono pradžioje VMFD „Žalgiris“ buvo vėl stipresnis už „Ekraną“. Šįkart „Žalgiris" po pratęsimo 1:0 įveikė Panevėžio komandą kovoje dėl Lietuvos Supertaurės.

Taip pat apginta praėjusiame sezone iškovota LFF taurė. Rungtynėse prieš „Šiaulius“ po papildomo laiko švieslentė rodė rezultatą 3:3 (2:2), tad komandos stojo mušti 11 metrų baudinių. Čia 8:7 buvo stipresni žalgiriečiai.

Gerai pradėję sezoną, jį žalgiriečiai puikiai ir užbaigė – dviem taškais aplenkęs Klaipėdos „Atlanto“ ekipą, VMFD „Žalgiris“ pagaliau triumfavo ir šalies pirmenybėse.

Sezonas buvo ypač įsimintinas ir dėl įspūdingo komandos žygio Europos lygos atrankoje. VMFD „Žalgiris“ pirmąkart Lietuvos istorijoje vienos kvalifikacijos metu eliminavo net 3 ekipas – Dublino „St Patrick's Athletic“ (Airija), Jerevano „Pyunik“ (Armėnija) bei Poznanės „Lech“ (Lenkija). Ketvirtajame etape VMFD „Žalgiris“ suklupo prieš Zalcburgo „Red Bull“ (Austrija) ekipą.

2014 metų sezoną VMFD „Žalgiris“ vėl šlavė varžovus iš kelio – iškovojo LFF taurę įveikdamas Gargždų „Bangą“ (2:1) bei triumfavo šalies pirmenybėse. Šįkart nuo artimiausio varžovo – Pakruojo „Kruojos“ – buvo atsiplėšta net 18 taškų.

2014 metų lapkričio 25 dieną, išsprendus teisinius ginčus, VMFD „Žalgiris“ tapo FK „Žalgiris“. Oficialiai legendinio Lietuvos klubo istorijos tesėju tapusi ekipa vėl pradėjo skaičiuoti savo istoriją nuo 1947-ų metų.

2015 metų gegužės 23-iąją dieną FK „Žalgiris“ LFF taurės finale 2:0 nugalėjo Klaipėdos „Atlantą“ ir taip paliko naują įrašą Lietuvos futbolo istorijoje. Tai buvo devintasis klubo iškovotas LFF taurės titulas ir ketvirtas iš eilės – dar nė vienai šalies komandai nepavyko pasiekti tokio rekordo. 
 
2016 metais „Žalgiris“ tęsė titulų medžioklę. Pirmose naujojo sezono rungtynėse vasario 28-ąją žalgiriečiai po pratęsimo 4:1 (1:1) įveikė „Trakų“ futbolininkus ir apgynė prieš trejus metus iškovotą Lietuvos Supertaurę. Gegužės 15-ąją Telšiuose vykusiose 2015–2016 metų LFF taurės turnyro finalinėse rungtynėse „Žalgiris“ po Lino Klimavičiaus įvarčio 1:0 palaužė „Trakus“ ir penktą kartą iš eilės iškovojo šį trofėjų. O rugsėjo 25-ąją Klaipėdoje – jau 2016 metų LFF taurės turnyro finale – žalgiriečiai 2:0 (0:0) susitvarkė su Marijampolės „Sūduva“ ir LFF taurę į viršų iškėlė šeštą kartą iš eilės. Iš viso žaliai balti federacijos taurės turnyre triumfavo jau 11 kartų.
 
Spalio 30-ąją „Žalgiris“ LFF stadione 2:0 įveikė „Atlantą“ ir, likus trims turams iki A lygos pirmenybių pabaigos, užsitikrino Lietuvos čempionų titulą. Šalies pirmenybėse žalgiriečiai triumfavo ketvirtą kartą iš eilės.
 
Keturiais pelnytais trofėjais paženklintame sezone pritrūko tik sėkmės UEFA Čempionų lygoje. Trečius metus iš eilės „Žalgiris“ savo pasirodymą šiame turnyre pradėjo (ir baigė) antrajame atrankos varžybų etape. Šį kartą pajėgiausias Lietuvos futbolo klubas bendru rezultatu 1:2 nusileido Kazachstano čempionams – „Astana“ futbolininkams.

2017 metų sezoną „Žalgiris“ pradėjo dar viena pergale Supertaurės rungtynėse. Antrus metus iš eilės žalgiriečiai kovoje dėl šio trofėjaus įveikė „Trakų“ futbolininkus. Vasario 26-ąją „Sportimos“ arenoje vykusiose rungtynėse „Žalgirio“ debiutantas Mahamane'as Traore pelnė vienintelį įvartį ir užtikrino savo ekipai pergalę 1:0 (0:0). Supertaurė žalgiriečiams atiteko penktą kartą iš eilės, o iš viso „Žalgiris“ šiuo trofėjumi per savo istoriją džiaugėsi šešis kartus. Pergalinga „Žalgirio“ serija Lietuvoje nutrūko tik rugsėjo 24-ąją, kai LFF taurės finale, kuris vyko Panevėžio „Aukštaitijos“ stadione, buvo 0:1 nusileista Kauno „Stumbrui“.

Šiuo metu FK „Žalgiriui“ vadovauja šiuolaikiškas, patyręs, ambicingas, moderniai mąstantis ir efektyviai veikiantis kolektyvas. Klubo administracija, treneriai ir futbolininkai tiki, kad futbolas Lietuvoje, ypač Vilniuje, turi didelį potencialą augti. Nuo 2010 metų „Žalgiris“ Lietuvoje iškovojo 15 titulų ir sustoti neketina. 2017 metais klubas švenčia savo 70-metį ir sieks jį padaryti įsimintinu ekipos sirgaliams.